Vanaf 1998 opereren beide havens onder één havenschap: Zeeland Seaports. Voor de samenvoeging werden de havens afzonderlijk bestuurd. Hieronder kunt u lezen hoe deze ontwikkeling tot stand is gekomen.

Havenschap Terneuzen
In 1960 gaf de toenmalige minister van Verkeer en Waterstaat te kennen de havens, kades, losplaatsen met bijbehorende werken en gronden langs het Nederlandse deel van het Kanaal Gent-Terneuzen, als één havengebied te willen besturen. Dit diende te gebeuren door een publiekrechterlijk lichaam, waarin de langs het kanaal gelegen gemeenten zouden samenwerken. Hiertoe werd in 1961 een studiecommissie Havenschap Terneuzen – Kanaalzone Zeeuwsch Vlaanderen ingesteld, waarin alle betrokken partijen vertegenwoordigd waren. De studiecommissie schreef in 1963 dat er in het gebied een doelbewust, intensief en elastisch havenbeheer was vereist, hetgeen alleen kon worden verwezenlijkt door de oprichting van een Havenschap Terneuzen.

Havenschap Vlissingen
Naar aanleiding van een schrijven van de directeur-generaal van Rijkswaterstaat van 28 november 1961 aan Gedeputeerde Staten van Zeeland, werd een studiecommissie opgericht om een gemeenschappelijke regeling inzake het beheer van het haven- en industriegebied Zuid-Sloe te onderzoeken. In deze commissie waren diverse partijen betrokken. De commissie presenteerde op 19 maart 1964 een ontwerp gemeenschappelijke regeling voor de oprichting van het Havenschap Vlissingen aan de minister van Verkeer en Waterstaat.

Bij Wet van 10 september 1970 en bij Wet van 8 april 1971 werden respectievelijk het Havenschap Terneuzen en het Havenschap Vlissingen opgericht. Binnen deze gemeenschappelijke regelingen werkten gemeenten, Rijk en Provincie samen.

De opzet van deze nieuwe havenorganisaties was een direct succes. In de loop der jaren breidde de overslag in het Zeeuws-Vlaamse havengebied zich uit van 3 naar 11,5 miljoen ton per jaar. De overslag van het Sloegebied vertoonde een groei van net onder 1 miljoen ton naar bijna 13 miljoen ton per jaar. Het aantal arbeidsplaatsen in beide havengebieden samen steeg tot bijna 13.500.

Eén Havenschap
In 1994 liet het Rijk weten haar deelname in de Zeeuwse havenschappen te willen beëindigen. Ook drong het Rijk er op aan de Zeeuwse havenschappen om te vormen tot één havenschap. In 1998 werd het fusieproces geformaliseerd en per 1 januari 1998 was het nieuwe havenschap Zeeland Seaports een feit.